22MMDB - Molekularna dijagnostika sa bioinformatikom
Specifikacija predmeta | ||||
---|---|---|---|---|
Naziv | Molekularna dijagnostika sa bioinformatikom | |||
Akronim | 22MMDB | |||
Studijski program | Biohemijsko inženjerstvo i biotehnologija | |||
Modul | ||||
Nastavnik (predavač) | ||||
Nastavnik/saradnik (vežbe) | ||||
Nastavnik/saradnik (DON) | ||||
Broj ESPB | 4.0 | Status predmeta | izborni predmet | |
Uslovljnost drugim predmetom | Oblik uslovljenosti | |||
Ciljevi izučavanja predmeta | Sticanje znanja o molekularnim tehnikama baziranim na genetskom materijalu koje se koriste za identifikaciju mikroorganizama | |||
Ishodi učenja (stečena znanja) | Nakon kursa student će posedovati teorijska znanja o molekularnoj osnovi za sistematiku živih bića, teorijska i praktična znanja o primeni 16/18 S rRNK molekula za identifikaciju organizama, teorijska i praktična znanja o molekularnim tehnikama za analizu kompleksnih mikrobnih ekosistema u hrani, vodi i u drugim biološkim sistemima. | |||
Sadržaj predmeta | ||||
Sadržaj teorijske nastave | Teorijske osnove o sistematici živih bića baziranoj na DNK sekvencama, potom i prednosti molekularnih metoda za analizu (kompleksnih) mikrobnih ekosistema. Akcenat predmeta je na objašnjenu principa i interpretaciji podataka dobijenih pomoću sledećih molekularnih tehnika: izolacije nukleinskih kiselina, tehnike Pi-Si-Ar; detekcije na osnovu ligacije, hibridizacije sa DNK probama na ćelijskom nivou ili na platformama DNK čipovima, tehnike profilisanja poput tehnike gel elektroforeze u prisustvu gradijenta denaturišuće komponente. Predmet će takođe dati osnove za bioinformatičke analize koje uključuju pretraživanje javnih baza podataka i poređenje i identifikaciju DNK sekvenci. | |||
Sadržaj praktične nastave | Praktičnu nastavu čine laboratorijske vežbe koje uključuju primenu nekih od teorijski izučenih molekularnih tehnika za dijagnostiku model ekosistema. Bioinformatičke vežbe uključuju analizu 16S ili 18S rRNK sekvenci u softverskim paketima ClustalX, R i ARB, pretraživanje javnih baza podataka i multivarijantna statistička obrada podataka. | |||
Literatura | ||||
| ||||
Broj časova aktivne nastave nedeljno tokom semestra/trimestra/godine | ||||
Predavanja | Vežbe | DON | Studijski i istraživački rad | Ostali časovi |
1 | 1 | 1 | ||
Metode izvođenja nastave | Predavanja, praktična nastava (laboratorijske i bioinformatičke vežbe). | |||
Ocena znanja (maksimalni broj poena 100) | ||||
Predispitne obaveze | Poena | Završni ispit | Poena | |
Aktivnosti u toku predavanja | 20 | Pismeni ispit | ||
Praktična nastava | 20 | Usmeni ispit | 60 | |
Projekti | ||||
Kolokvijumi | ||||
Seminari |