22ММДБ - Молекуларна дијагностика са биоинформатиком
Спецификација предмета | ||||
---|---|---|---|---|
Назив | Молекуларна дијагностика са биоинформатиком | |||
Акроним | 22ММДБ | |||
Студијски програм | Биохемијско инжењерство и биотехнологија | |||
Модул | ||||
Наставник (предавач) | ||||
Наставник/сарадник (вежбе) | ||||
Наставник/сарадник (ДОН) | ||||
Број ЕСПБ | 4.0 | Статус предмета | изборни предмет | |
Условљност другим предметом | Облик условљености | |||
Циљеви изучавања предмета | Стицање знања о молекуларним техникама базираним на генетском материјалу које се користе за идентификацију микроорганизама | |||
Исходи учења (стечена знања) | Након курса студент ће поседовати теоријска знања о молекуларној основи за систематику живих бића, теоријска и практична знања о примени 16/18 С рРНК молекула за идентификацију организама, теоријска и практична знања о молекуларним техникама за анализу комплексних микробних екосистема у храни, води и у другим биолошким системима. | |||
Садржај предмета | ||||
Садржај теоријске наставе | Tеоријске основе о систематици живих бића базираној на ДНК секвенцамa, потом и предности молекуларних метода за анализу (комплексних) микробних екосистема. Акценат предмета је на објашњену принципа и интерпретацији података добијених помоћу следећих молекуларних техника: изолације нуклеинских киселина, технике Пи-Си-Ар; детекције на основу лигације, хибридизације са ДНК пробама на ћелијском нивоу или на платформама ДНК чиповима, технике профилисања попут технике гел електрофорезе у присуству градијента денатуришуће компоненте. Предмет ће такође дати основе за биоинформатичке анализе које укључују претраживање јавних база података и поређење и идентификацију ДНК секвенци. | |||
Садржај практичне наставе | Практичну наставу чине лабораторијске вежбе које укључују примену неких од теоријски изучених молекуларних техника за дијагностику модел екосистема. Биоинформатичке вежбе укључују анализу 16S или 18S рРНК секвенци у софтверским пакетима ClustalX, R и ARB, претраживање јавних база података и мултиваријантна статистичка обрада података. | |||
Литература | ||||
| ||||
Број часова активне наставе недељно током семестра/триместра/године | ||||
Предавања | Вежбе | ДОН | Студијски и истраживачки рад | Остали часови |
1 | 1 | 1 | ||
Методе извођења наставе | Предавања, практична настава (лабораторијске и биоинформатичке вежбе). | |||
Оцена знања (максимални број поена 100) | ||||
Предиспитне обавезе | Поена | Завршни испит | Поена | |
Активности у току предавања | 20 | Писмени испит | ||
Практична настава | 20 | Усмени испит | 60 | |
Пројекти | ||||
Колоквијуми | ||||
Семинари |